Химические рибонуклеазы. 4. Анализ фрагментной структуры химических рибонуклеаз на основе 1,4-диазабицикло[2.2.2]октана
Full article
| Общее |
Language:
Русский,
Genre:
Full article,
Status:
Published,
Source type:
Original
|
| Journal |
Биоорганическая химия
ISSN: 0132-3423
, E-ISSN: 1998-2860
|
| Output data |
Year: 2002,
Volume: 28,
Number: 4,
Pages: 367-378
Pages count
: 12
|
| Tags |
Artificial ribonucleases, Domain structure, Hydrolysis, RNA |
| Authors |
Коневец Д.А.
1
,
Миронова Н.Л.
2
,
Бекк И.Э.
3
,
Зенкова М.А.
1
,
Шишкин Г.В.
1
,
Власов В.В.
1
,
Сильников В.Н.
1
|
| Affiliations |
| 1 |
Новосибирский институт биоорганической химии СО РАН, 630090, Новосибирск, просп. Лаврентьева, 8
|
| 2 |
Новосибирский государственный университет, Новосибирск
|
| 3 |
Институт катализа им. Г.К. Борескова СО РАН, Новосибирск
|
|
Funding (4)
|
1
|
Russian Foundation for Basic Research
|
00-15-97969
|
|
2
|
Russian Foundation for Basic Research
|
99-04-49538
|
|
3
|
Wellcome Trust
|
063630
|
|
4
|
International Association for the Promotion of Co-operation with Scientists from the New Independent States of the Former Soviet Union
|
96-1418
|
Синтезированы искусственные рибонуклеазы серии ABLkCm, состоящие из липофильного алкильного радикала (Et, n-Cl4H29 или C15H31) А, а также РНК-связывающего домена В (бисчетвертичная соль 1,4-диазабицикло[2.2.2]октана) и каталитического домена Cm (остаток гистамина (С1) или гистидина (С3)), соединенных линкером Lk (k - число метиленовых звеньев (1 или 3) в линкере). На примере семи соединений этой серии (ABL1C1, ABL3C1, ABL3C3, АС1, АВ, BL2, BL3C3) проведен анализ влияния доменной структуры на каталитические свойства химических рибонуклеаз. Каталитическая активность соединений определялась в реакции гидролиза in vitro транскриптов тPHKLys человека и тPHKAsp дрожжей в физиологических условиях. Показано, что только химические рибонуклеазы, включающие все фрагменты конструкции ABLkCm, характеризуются высокой скоростью гидролиза РНК-субстрата (90% тРНК гидролизуется за 10 ч при 37°С), причем активность соединений в значительной степени определяется наличием в конструкции длинного липофильного радикала, связанного с 1,4-диазабицикло[2.2.2]октаном, и длинного линкера, связывающего РНК-гидролизующий и РНК-связывающий фрагменты. Полученные результаты свидетельствуют о важной роли гидрофобных взаимодействий в ускорении реакции гидролиза РНК.