Коллекция микроорганизмов ИЦИГ СО РАН как генетический ресурс для биотехнологии Full article
Journal |
Вавиловский журнал генетики и селекции
ISSN: 2500-0462 , E-ISSN: 2500-3259 |
||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Output data | Year: 2017, Volume: 21, Number: 6, Pages: 630-637 Pages count : 8 DOI: 10.18699/VJ17.279 | ||||||
Tags | Biotechnology, Collection of microorganisms, Extreme ecosystems, Genetic resource, Molecular genetic and phenotypic characteristics, Strain | ||||||
Authors |
|
||||||
Affiliations |
|
Funding (2)
1 | Russian Foundation for Basic Research | 17-44-540815 |
2 | Federal Agency for Scientific Organizations | 0324-2017-0003 |
Abstract:
В создании новых биотехнологий важное значение имеют генетические знания о микроорганизмах, так как эффективность любых биотехнологий определяется особенностями структурно-функциональной организации молекулярно-генетических систем и их компонент, используемых для наработки целевых продуктов. При этом коллекции микробных культур играют решающую роль в мобилизации биологических ресурсов и позволяют сформировать прочную базу для генетических, молекулярно-биологических и биотехнологических исследований. Целью данной работы было проведение оценки ключевых молекулярно-генетических и фенотипических характеристик штаммов коллекции микроорганизмов, созданной в Федеральном исследовательском центре Институт цитологии и генетики (ФИЦ ИЦиГ) СО РАН, в качестве генетического ресурса для биотехнологии. Для 30 штаммов микроорганизмов коллекции, выделенных сотрудниками ИЦиГ из экстремальных природных экосистем, осуществлено описание ключевых молекулярно-генетических и фенотипических характеристик с использованием современных методов молекулярной биологии и масс-спектрометрии. Проведено выделение ДНК и секвенирование последовательностей генов 16S рРНК. Штаммы коллекции охарактеризованы по морфологическим, физиологическим, молекулярно-генетическим и масс-спектрометрическим характеристикам. Установлены особенности роста штаммов на разных средах, изучена морфология клеток. Штаммы протестированы на способность использовать различные субстраты. Установлены физиологические характеристики штаммов коллекции (отношение к кислороду, тип питания, диапазон температур и рН, отношение к NaCl и др.), различная устойчивость штаммов к антибиотикам. Определены хемотаксономические характеристики по составу жирных кислот штаммов коллекции. Проведено создание характеристичных масс-спектров белковых профилей исследованных штаммов коллекции. Получены и задепонированы в ГенБанке последовательности ДНК штаммов. Выполнена оценка биотехнологических свойств штаммов, определено содержание метаболитов (этанола, молочной и уксусной кислот) в культуральной жидкости. Ценность коллекции микроорганизмов ФИЦ ИЦиГ СО РАН как генетического ресурса для биотехнологии и биоинженерии определяется не только видовым разнообразием входящих в нее штаммов и широким ареалом их выделения, но и глубиной их характеризации с использованием максимально широкого арсенала как классических, так и современных методов, включая методы геномики, протеомики, транскриптомики и биоинформатики.
Cite:
Брянская Л.В.
, Уварова Ю.Е.
, Розанов А.С.
, Слынько Н.М.
, Шляхтун В.Н.
, Старостин К.В.
, Демидов Е.А.
, Лазарева Е.В.
, Таран О.П.
, Пельтек С.Е.
Коллекция микроорганизмов ИЦИГ СО РАН как генетический ресурс для биотехнологии
Вавиловский журнал генетики и селекции. 2017. Т.21. №6. С.630-637. DOI: 10.18699/VJ17.279 RSCI Scopus РИНЦ
Коллекция микроорганизмов ИЦИГ СО РАН как генетический ресурс для биотехнологии
Вавиловский журнал генетики и селекции. 2017. Т.21. №6. С.630-637. DOI: 10.18699/VJ17.279 RSCI Scopus РИНЦ
Files:
Full text from publisher
Dates:
Published online: | Jan 1, 2017 |
Submitted: | Sep 7, 2017 |
Accepted: | Sep 29, 2017 |
Identifiers:
RSCI | RSCI:30352603 |
Scopus | 2-s2.0-85037609888 |
Elibrary | 30352603 |
OpenAlex | W2770137176 |
publication.block.citing_info:
БД | Цитирований |
---|---|
Elibrary | 1 |