Коллекция микроорганизмов ИЦИГ СО РАН как генетический ресурс для биотехнологии
Full article
| Journal |
Вавиловский журнал генетики и селекции
ISSN: 2500-0462
, E-ISSN: 2500-3259
|
| Output data |
Year: 2017,
Volume: 21,
Number: 6,
Pages: 630-637
Pages count
: 8
DOI:
10.18699/VJ17.279
|
| Tags |
Biotechnology, Collection of microorganisms, Extreme ecosystems, Genetic resource, Molecular genetic and phenotypic characteristics, Strain |
| Authors |
Брянская Л.В.
1
,
Уварова Ю.Е.
1
,
Розанов А.С.
1
,
Слынько Н.М.
1
,
Шляхтун В.Н.
1
,
Старостин К.В.
1
,
Демидов Е.А.
1
,
Лазарева Е.В.
2
,
Таран О.П.
3
,
Пельтек С.Е.
1
|
| Affiliations |
| 1 |
Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук
|
| 2 |
Институт геологии и минералогии им. В.С. Соболева Сибирского отделения Российской академии наук
|
| 3 |
Институт катализа им. Г.К. Борескова Сибирского отделения Российской академии наук
|
|
Funding (2)
|
1
|
Russian Foundation for Basic Research
|
17-44-540815
|
|
2
|
Federal Agency for Scientific Organizations
|
0324-2017-0003
|
В создании новых биотехнологий важное значение имеют генетические знания о микроорганизмах, так как эффективность любых биотехнологий определяется особенностями структурно-функциональной организации молекулярно-генетических систем и их компонент, используемых для наработки целевых продуктов. При этом коллекции микробных культур играют решающую роль в мобилизации биологических ресурсов и позволяют сформировать прочную базу для генетических, молекулярно-биологических и биотехнологических исследований. Целью данной работы было проведение оценки ключевых молекулярно-генетических и фенотипических характеристик штаммов коллекции микроорганизмов, созданной в Федеральном исследовательском центре Институт цитологии и генетики (ФИЦ ИЦиГ) СО РАН, в качестве генетического ресурса для биотехнологии. Для 30 штаммов микроорганизмов коллекции, выделенных сотрудниками ИЦиГ из экстремальных природных экосистем, осуществлено описание ключевых молекулярно-генетических и фенотипических характеристик с использованием современных методов молекулярной биологии и масс-спектрометрии. Проведено выделение ДНК и секвенирование последовательностей генов 16S рРНК. Штаммы коллекции охарактеризованы по морфологическим, физиологическим, молекулярно-генетическим и масс-спектрометрическим характеристикам. Установлены особенности роста штаммов на разных средах, изучена морфология клеток. Штаммы протестированы на способность использовать различные субстраты. Установлены физиологические характеристики штаммов коллекции (отношение к кислороду, тип питания, диапазон температур и рН, отношение к NaCl и др.), различная устойчивость штаммов к антибиотикам. Определены хемотаксономические характеристики по составу жирных кислот штаммов коллекции. Проведено создание характеристичных масс-спектров белковых профилей исследованных штаммов коллекции. Получены и задепонированы в ГенБанке последовательности ДНК штаммов. Выполнена оценка биотехнологических свойств штаммов, определено содержание метаболитов (этанола, молочной и уксусной кислот) в культуральной жидкости. Ценность коллекции микроорганизмов ФИЦ ИЦиГ СО РАН как генетического ресурса для биотехнологии и биоинженерии определяется не только видовым разнообразием входящих в нее штаммов и широким ареалом их выделения, но и глубиной их характеризации с использованием максимально широкого арсенала как классических, так и современных методов, включая методы геномики, протеомики, транскриптомики и биоинформатики.
Вавиловский журнал генетики и селекции. 2017.
Т.21. №6. С.630-637. DOI: 10.18699/VJ17.279RSCI
Scopus
РИНЦ
OpenAlex