Sciact
  • EN
  • RU

Факторы, влияющие на стабильность тримерной формы 2'-дезоксиуридин-5'-трифосфатнуклеотидгидролазы Escherichia coli Научная публикация

Журнал Молекулярная биология
ISSN: 0026-8984
Вых. Данные Год: 2023, Том: 57, Номер: 2, Страницы: 330-339 Страниц : 10 DOI: 10.31857/s0026898423020246
Ключевые слова dUTPаза, белок-белковые взаимодействия, олигомеризация, дифференциальная сканирующая флуориметрия
Авторы Юдкина А.В. 1,2 , Коваленко Е.А. 3 , Ендуткин А.В. 1 , Панфёрова Е.П. 1 , Кириленко А.А. 3 , Коханенко А.А. 3 , Жарков Д.О. 1,2
Организации
1 Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения Российской академии наук, Новосибирск, 630090 Россия
2 Новосибирский государственный университет, Новосибирск, 630090 Россия
3 Томский государственный университет, Томск, 634050 Россия

Реферат: Фермент 2'-дезоксиуридин-5′-трифосфатнуклеотидгидролаза (Dut), гидролизующий dUTP до dUMP и пирофосфата, предотвращает ошибочное включение dUMP в ДНК из метаболического пула dUTP и рассматривается как перспективная фармакологическая мишень для антиметаболитной терапии. Активный фермент Dut представляет собой тример, связывающий субстрат в межсубъединичной области. С использованием высокоскоростной наномасштабной дифференциальной сканирующей флуориметрии (nanoDSF) нами изучено влияние различных физико-химических факторов на стабильность тримера Dut Escherichia coli. В отличие от мономерных белков температурная денатурация Dut происходит в два этапа, первый из которых соответствует распаду тримера до мономерных субъединиц. Показано, что основной вклад в стабилизацию тримера вносят гидрофобные взаимодействия и водородные связи на интерфейсах взаимодействия между субъединицами. Тример Dut частично стабилизируется при связывании нуклеотидных лигандов. В целом метод nanoDSF удобен для скрининга низкомолекулярных соединений, способных дестабилизировать активный тример Dut.
Библиографическая ссылка: Юдкина А.В. , Коваленко Е.А. , Ендуткин А.В. , Панфёрова Е.П. , Кириленко А.А. , Коханенко А.А. , Жарков Д.О.
Факторы, влияющие на стабильность тримерной формы 2'-дезоксиуридин-5'-трифосфатнуклеотидгидролазы Escherichia coli
Молекулярная биология. 2023. Т.57. №2. С.330-339. DOI: 10.31857/s0026898423020246 Scopus OpenAlex
Даты:
Поступила в редакцию: 29 июл. 2022 г.
Принята к публикации: 16 авг. 2022 г.
Идентификаторы БД:
Scopus: 2-s2.0-85151574758
OpenAlex: W4362522966
Цитирование в БД:
БД Цитирований
OpenAlex 1
Альметрики: