Факторы, влияющие на стабильность тримерной формы 2'-дезоксиуридин-5'-трифосфатнуклеотидгидролазы Escherichia coli | Sciact - CRIS-system of Boreskov Institute of Catalysis

Факторы, влияющие на стабильность тримерной формы 2'-дезоксиуридин-5'-трифосфатнуклеотидгидролазы Escherichia coli Full article

Journal

Молекулярная биология
ISSN: 0026-8984

Output data

Year: 2023, Volume: 57, Number: 2, Pages: 330-339 Pages count : 10 DOI: 10.31857/s0026898423020246

Tags

dUTPаза, белок-белковые взаимодействия, олигомеризация, дифференциальная сканирующая флуориметрия

Authors

Юдкина А.В. ^1,2 , Коваленко Е.А. ³ , Ендуткин А.В. ¹ , Панфёрова Е.П. ¹ , Кириленко А.А. ³ , Коханенко А.А. ³ , Жарков Д.О. ^1,2

Affiliations

1	Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения Российской академии наук, Новосибирск, 630090 Россия
2	Новосибирский государственный университет, Новосибирск, 630090 Россия
3	Томский государственный университет, Томск, 634050 Россия

Фермент 2'-дезоксиуридин-5′-трифосфатнуклеотидгидролаза (Dut), гидролизующий dUTP до dUMP и пирофосфата, предотвращает ошибочное включение dUMP в ДНК из метаболического пула dUTP и рассматривается как перспективная фармакологическая мишень для антиметаболитной терапии. Активный фермент Dut представляет собой тример, связывающий субстрат в межсубъединичной области. С использованием высокоскоростной наномасштабной дифференциальной сканирующей флуориметрии (nanoDSF) нами изучено влияние различных физико-химических факторов на стабильность тримера Dut Escherichia coli. В отличие от мономерных белков температурная денатурация Dut происходит в два этапа, первый из которых соответствует распаду тримера до мономерных субъединиц. Показано, что основной вклад в стабилизацию тримера вносят гидрофобные взаимодействия и водородные связи на интерфейсах взаимодействия между субъединицами. Тример Dut частично стабилизируется при связывании нуклеотидных лигандов. В целом метод nanoDSF удобен для скрининга низкомолекулярных соединений, способных дестабилизировать активный тример Dut.

Юдкина А.В. , Коваленко Е.А. , Ендуткин А.В. , Панфёрова Е.П. , Кириленко А.А. , Коханенко А.А. , Жарков Д.О.
Факторы, влияющие на стабильность тримерной формы 2'-дезоксиуридин-5'-трифосфатнуклеотидгидролазы Escherichia coli
Молекулярная биология. 2023. Т.57. №2. С.330-339. DOI: 10.31857/s0026898423020246 Scopus РИНЦ OpenAlex

Submitted:	Jul 29, 2022
Accepted:	Aug 16, 2022

Scopus:	2-s2.0-85151574758
Elibrary:	50434628
OpenAlex:	W4362522966

DB	Citing
OpenAlex	1